[中报]诺禾致源(688315):北京诺禾致源科技股份有限公司2024年半年度报告
原标题:诺禾致源:北京诺禾致源科技股份有限公司2024年半年度报告 北京诺禾致源科技股份有限公司 2024年半年度报告 重要提示 一、 本公司董事会、监事会及董事、监事、高级管理人员保证半年度报告内容的真实性、准确性、完整性，不存在虚假记载、误导性陈述或重大遗漏，并承担个别和连带的法律责任。 二、 重大风险提示 报告期内，不存在对公司生产经营产生实质性影响的特别重大风险，并已在本报告中详细阐述在公司生产经营过程中可能面临的风险及应对措施，敬请查阅本报告第三节“管理层讨论与分析”之“五、风险因素”部分内容。 三、 公司全体董事出席董事会会议。 四、 本半年度报告未经审计。 五、 公司负责人李瑞强、主管会计工作负责人施加山及会计机构负责人（会计主管人员）陈伟声明：保证半年度报告中财务报告的真实、准确、完整。 六、 董事会决议通过的本报告期利润分配预案或公积金转增股本预案 无 七、 是否存在公司治理特殊安排等重要事项 □适用 √不适用 八、 前瞻性陈述的风险声明 √适用 □不适用 本报告所涉及的公司未来计划、发展战略等前瞻性陈述，不构成公司对投资者的实质承诺，请投资者保持足够的风险防范意识，并且应当理解计划、预测与实际之间的差异，注意投资风险。 九、 是否存在被控股股东及其他关联方非经营性占用资金情况 否 十、 是否存在违反规定决策程序对外提供担保的情况 否 十一、 是否存在半数以上董事无法保证公司所披露半年度报告的真实性、准确性和完整性 否 十二、 其他 □适用 √不适用 目录 第一节 释义 .......................................................................................................................5 第二节 公司简介和主要财务指标 ...................................................................................8 第三节 管理层讨论与分析 .............................................................................................11 第四节 公司治理 .............................................................................................................43 第五节 环境与社会责任 .................................................................................................44 第六节 重要事项 .............................................................................................................47 第七节 股份变动及股东情况 .........................................................................................78 第八节 优先股相关情况 .................................................................................................84 第九节 债券相关情况 .....................................................................................................85 第十节 财务报告 .............................................................................................................86
第一节 释义 在本报告书中，除非文义另有所指，下列词语具有如下含义：
第二节 公司简介和主要财务指标 一、 公司基本情况
二、 联系人和联系方式
三、 信息披露及备置地点变更情况简介
四、 公司股票/存托凭证简况 (一) 公司股票简况 √适用 □不适用 公司股票简况
(二) 公司存托凭证简况 □适用 √不适用 五、 其他有关资料 □适用 √不适用 六、 公司主要会计数据和财务指标 (一) 主要会计数据 单位：元 币种：人民币
(二) 主要财务指标
公司主要会计数据和财务指标的说明 √适用 □不适用 报告期公司营业收入 99,665.27万元，较上年同期增长 7.18%，主要系报告期内中国大陆、港澳台及海外地区营业收入均增长所致，其中中国大陆营收 49,569.09万元，同比增长 6.27%；港澳台及海外地区营收 50,096.18万元，同比增长 8.09%。 公司实现归属于上市公司股东的净利润 7,792.69万元，相比上年同期增长 3.86%，主要系报告期公司营业收入的增加带来的毛利增加影响。 报告期公司实现归属于上市公司股东的扣除非经常性损益的净利润 6,591.07 万元，相比上年同期增长 12.92%，主要系报告期公司营业收入增加带来毛利增加、非经常性损益中增值税加计抵减政策到期带来其他收益金额减少影响。 报告期公司经营活动产生的现金净流量-8,234.33 万元，上年同期-451.35 万元，主要系报告期营收回款短期波动，以及公司增值税留抵退税减少、预缴所得税增加影响。 报告期公司基本每股收益及稀释每股收益 0.19元/股，与去年同期持平。 报告期公司扣除非经常性损益后的基本每股收益 0.16 元/股，相比上年同期增加6.67%，主要系报告期公司营业收入增加带来毛利增加、非经常性损益中增值税加计抵减政策到期带来其他收益金额减少影响。 境内外会计准则下会计数据差异 □适用 √不适用 七、 非经常性损益项目和金额 √适用 □不适用 单位:元 币种:人民币
对公司将《公开发行证券的公司信息披露解释性公告第1号——非经常性损益》未列举的项目认定为的非经常性损益项目且金额重大的，以及将《公开发行证券的公司信息披露解释性公告第1号——非经常性损益》中列举的非经常性损益项目界定为经常性损益的项目，应说明原因 □适用 √不适用 八、 非企业会计准则业绩指标说明 □适用 √不适用 第三节 管理层讨论与分析 一、 报告期内公司所属行业及主营业务情况说明 1、所属行业 根据《国民经济行业分类》（GB/T4754-2017），公司所属行业为科学研究和技术服务业（M）中的专业技术服务（M74）；根据国家统计局《战略性新兴产业（2018）》，公司业务属于 4.1.5生物医药相关服务中的基因测序专业技术服务。 生物产业是当今发展最快的行业之一。进入 21 世纪以来，以分子设计、基因操作和基因组学为核心的技术突破，推动了以生命科学为支撑的生物产业深刻改革，生物技术进入大规模产业化的加速发展新阶段，生物医药、生物农业日趋成熟，生物制造、生物能源、生物环保快速兴起，对解决人类面临的人口、健康、粮食、能源、环境等主要问题具有重大战略意义。 生物科技行业是以生命科学理论和现代生物技术为基础发展起来的、专门从事生物技术产品开发、生产、流通和服务的产业群，包括生物医药、生物农业、生物化工、生物能源、生物制造、生物环保和生物服务等。从产业链的角度看，它既包括为生物技术研发提供支持的设备、制剂以及相关信息的服务业，也包括运用生物技术工艺进行生产或提供服务的产业，还包括相应的储、运、销售等需要专门的生物技术知识与技能的产业。而其中，蓬勃发展的科技服务企业，专注于生物研究技术手段的研发创新，并致力于提高效率、降低成本，使得下游科研机构能够负担得起新技术手段、快速获得结果，为高效的科研成果产出提供必要的前提。 全球基因测序行业的市场规模巨大，随着基因测序相关技术的持续革新和应用领域的深入发展，行业竞争格局也在不断演化。基因测序的产业链上游为测序仪器、设备和试剂供应商；中游为基因测序服务提供商；下游为使用者，包括医疗机构、科研机构、制药公司。诺禾致源主要面对来自基因测序服务提供商的竞争。 基因测序服务提供商根据客户类别的不同，主要分为两大类，一是面向基础研究的基因测序服务提供商；二是面向终端用户的临床、医疗类的基因检测服务提供商，服务内容以无创产前基因检测为主，还包括药物靶向治疗检测、遗传缺陷基因检测、肿瘤基因检测、病原微生物检测、疾病风险评估等。第一类服务提供商包括国内的诺禾致源、百迈客以及韩国的 Macrogen 等，第二类服务提供商包括燃石医学、世和基因等。华大基因、贝瑞基因、安诺优达等公司则两种服务均有所涉及。 2、主营业务情况 公司主要依托高通量测序技术和生物信息分析技术，建立了通量规模领先的基因测序平台，并结合多组学研究技术手段，为生命科学基础研究、医学及临床应用研究提供多层次的科研技术服务及解决方案；同时，基于在基因测序及其应用领域的技术积累，自主开发创新的基因检测医疗器械。 在创新驱动和效率驱动的研发战略导向下，公司搭建了通量规模领先、测序质量稳定、高效交付的基因测序平台，并始终在各项高难度基因测序技术保持领先地位，全面掌握基因组学、蛋白质组学、代谢组学及多组学整合研究技术体系，形成从基础研究、转化研究到临床应用的跨领域协同优势，截至 2024年 6月 30日，诺禾致源联合署名发表或被提及的 SCI文章总计 26,522余篇，累计影响因子 176,929.89，取得发明专利 76项、软件著作权 425项。 公司构建了全球化的技术服务网络，在境内设有天津、上海及广州实验室，在美国、英国、新加坡、德国、日本建立了本地化运营的实验室，于中国香港、新加坡、美国、英国、荷兰、日本等国家和地区设有子公司，业务覆盖全球六大洲约 90 个国家和地区，实现对北美、欧洲、东南亚等本地科研需求的快速响应，全面覆盖中国科学院、中国医学科学院、中国农业科学院、北京大学、清华大学、浙江大学、四川大学、中山大学、Stanford University、University of California、Genome Institute of Singapore等境内外一流科研院所，服务客户近 7300家。 公司积极开拓基因技术在临床应用的发展。公司第三类医疗器械“人 EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒（半导体测序法）” 于 2018年 8月通过 NMPA 创新医疗器械特别审评通道审批上市，成为我国首批获准上市的基于高通量测序的肿瘤基因检测试剂盒之一，是国内临床试验样本量最大的基因检测获批产品。 3、公司主要产品及服务 公司产品主要包括生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库测序平台服务。主要产品及用途如下：
生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务、建库测序平台服务之间的具体差异如下： （1）服务内容：三类服务均提供基因测序服务，但测序对象不同，生命科学基础科研服务的测序对象为动物、植物、微生物等与人体无关的样本，医学研究与技术服务的测序对象为与人体有关的样本； （2）服务流程与交付成果：生命科学基础科研服务、医学研究与技术服务的流程包括样本检测、核酸提取、文库构建、上机测序、数据分析，交付成果为数据分析结果；建库测序平台服务通过平台化服务和标准化产品的推广，将客户的非标的解决方 案，转化为标准化产品，以自动化流程，更高效率和更稳定质量完成交付； （3）三类服务的客户群体基本相同。 4、主要经营模式 4.1、采购模式 （1）供应商选择与考核 公司原材料供应商分为核心原材料供应商和非核心原材料供应商两类管理。公司 核心供应商主要提供基因检测设备和试剂。公司主要通过国内代理商采购，或者与厂 家直接采购的方式与供应商进行长期合作。非核心原材料供应商公司主要采取合格供 应商信用评级。公司根据采购需求将具备相应资质的供应商列入初选供应商名单，随 后通过调研考察供应商的产品质量和供应能力，对样品进行检测和试用，完成供应商 调查评审，将符合要求的供应商列入《合格供应商名录》，并与这些供应商保持长期 稳定的合作关系，并且通过周期性回访对供应商进行产品质量、交货周期、价格、服 务、供应商综合实力等方面进行评审，对合格供应商目录进行维护。 在企业数字化建设进程推进下，诺禾致源采用线上供应商关系管理平台， 包括 供应商的评估、选择、合同管理、订单管理、付款管理等方面一体化协同管理。从供 应商门户、内部系统到供应商关系管理平台进行统一的协调管理，实现供应链全生命 周期与采购全流程的高效监管。诺禾致源致力于持续优化并延伸供应商链结构，通过 完善的供应商准入审核流程及供应商库管理制度不断加强责任供应链建设。 （2）采购流程 公司的采购流程如下： 公司实验中心依据库存和生产计划，预估制定采购计划，提出采购申请，采购申请经过需求部门负责人及采购部负责人的审核后，由采购员汇总采购需求，并向《合格供应商名录》中的供应商询价，由采购部门相关人员与供应商进行合同条款的协商、签署采购合同。货到后由公司仓库人员按照库房管理制度进行验收入库。采购人员进行发票核对和付款申请，经财务部门审核后完成付款。 4.2、生产服务模式 公司采取订单型生产模式，以订单或项目形式接入生产任务。公司实验中心根据历史项目数据分析结果、项目接收趋势预测制定季度或月度生产计划，进行产能分配；根据项目实际接入情况，考虑客户重要性、项目规模、项目紧急程度等因素制订短期生产计划，并发放至各产线执行。 公司向客户提供测序服务的流程如下： ①收集样本：公司销售端取得客户委托服务标本，填写样本信息，寄送公司生产基地（测序实验室）；公司收样人员核对标本的信息，检查是否信息有误或者标本有异常。 ②信息提取：检查无误后交由公司实验人员从样本中去除杂质、抽提出核酸等测序物质。由于样本来源包括人、动物、植物及微生物，涉及不同的组织、形态，需要针对不同类型的样本分别开发核酸提取方法，尤其对于微量、多年保存以及特殊形态的难提样本，需要对提取方法进行个性化优化。公司已针对相对标准化的样本提取搭建了自动化提取流程，对于非标样本，积累了百余种个性化提取方法。 ③建库：将核酸进行打断、末端修复、扩增等处理，制作样本浓度、片段长度等符合不同技术原理、不同型号测序仪要求的文库，为测序仪识别样本做准备工作。公司已实现了标准文库构建的自动化，并积累了对非标建库流程差异化处理的丰富经验。 ④上机测序：准备完成后，由测序仪进行测序读取碱基信息。由于现有的主流测序仪通量较大，需要多样本同批次上机，该环节的重点在于减少不同文库间的相互影响，保证文库测序产出的均一性。 ⑤信息发掘与报告生成：测序完成后，公司生物信息分析工程师对测序仪给出的样本信息进行信息发掘，并出具解读报告并发送给客户。特别是第二代测序，因读长短、建库环节需要将完整的DNA打断成较小的片段，重组装对信息分析技术有较高的要求。而解读海量的基因组数据，甚至基因结合转录组、蛋白质、代谢等多组学数据，也对信息分析技术作出了更高的要求。 公司在上述每一个环节均设置有质量控制，样本通过QC检测方可进入下一环节，保证检测结果的准确性和有效性。同时，公司持续提高各环节的自动化水平，减少人工使用及人工误判，提高测序效率及质量稳定性。 4.3、销售模式 公司客户一般为科研机构、医院、药企等企事业单位，通常采用直销的销售模式。 公司在各地建立专业的销售和技术支持团队，对客户进行直接覆盖。销售人员通过日常拜访、参与专业会议等渠道发掘合作意向，在售前深入了解客户的研究需求后，结合公司的多组学技术方案能力，与技术支持团队共同设计既切实可行又具有前瞻性的项目服务方案，最终完成意向落地和合同签署。 鉴于公司通常采用直销的销售模式，为了更广泛地触达客户，更高效地响应客户需求，同时顺应科技及社会发展趋势，公司积极推动营销模式数字化，通过各种线上渠道，提升产品认知度，展示产品应用场景和真实的使用案例，通过网站、社交媒体、第三方平台、电子邮件和线上会议等形式与客户互动，帮助客户更好地了解产品特点与优势，更合理地设计研究项目、选择研究策略。收集到客户留言后，系统会将客户需求第一时间转给销售，以便销售继续跟进，最终实现意向转化。在项目执行过程中，销售、技术支持和项目运营人员为客户提供全流程的服务，包括对样本准备过程中需要注意的问题和技术标准进行指导、对项目进度的把控以及对客户在项目进行过程的临时性疑问或需求进行回复等，通过全流程、一对一的专业服务，与客户建立良好、长期的合作关系。 公司境外销售模式与境内销售模式基本一致，主要采用直销的销售模式。同时， 公司境外存在少量经销业务，主要系部分国家和地区公司境外子公司尚无直接覆盖客 户能力，故通过与本地经销商开展合作方式进入当地市场。 销售的具体销售流程如下： 二、 核心技术与研发进展 1. 核心技术及其先进性以及报告期内的变化情况 自成立之初，诺禾致源以从头测序（de novo）核心技术成功开拓科研服务市场，在创新驱动和效率驱动的研发导向下，建立了自主的核心技术体系，为公司紧跟生命科学研究前沿及可持续创新发展奠定了坚实基础。 （1）全面的基因测序实验操作技术和信息化管理体系 在提取环节，对客户样本持续进行负面清单专项优化。其中，针对土壤、拭子、体液及动物组织类等微生物样本的提取方法开发和优化，同时匹配高通量全自动化的微生物扩增生产模式，最终达成微生物提取扩增合格率 98.69%的效果；针对细菌类样本、微量土壤和组织样本、拭子类样本、速冻血液类样本、Trizol保存血液类样本、以及 Meta、FFPE、特殊植物、干燥叶片、海产类等特殊难提取物种样本，开发了优化提取方法，稳步提升客户样本 DNA/RNA提取合格率，其中 DNA 提取合格率达到94.32%，RNA提取合格率达到 92.27%。通过多物种 DNA/RNA提取专项研发和优化，为客户提供高效的提取解决方案和优质服务，为客户的科研提供坚实的基础保障。 在建库环节，针对微生物扩增子产品，设计了特异标识序列，在实验流程中引入样本内控质量管理工具，即从PCR扩增环节开始，经历建库、测序直至最后的生物信息学分析环节，全流程实现数据实时监控、污染来源识别和数据质量保障，为客户提供最优质可靠的扩增子产品服务。在交付能力提升方面，一方面，微生物扩增建库流程引入超微量移液设备，优化生产模式，产能提升显著；另一方面，我们根据客户需求，在更多区域新建或扩建建库类型。 在实验室全球化建设方面，上海实验室上线全基因组建库测序、真核普通转录组建库测序产品；新加坡实验室新增了 Nanopore 长读长建库测序产品；日本实验室上线全基因组建库测序产品；德国实验室上线全基因组建库测序、真核普通转录组建库测序和 Pacbio Revio长读长建库测序产品。在确保服务质量和运营效率的基础上，我们将更贴近客户，成为全球科学家可信赖的科研合作伙伴；同时，对天津、广州、上海、英国、美国等实验室小型柔性智能交付系统 Falcon II进行升级，显著缩短样本建库周期，再次实现产能提升，为客户提供更短的交付周期和更好的服务质量。 在测序方面，紧跟行业发展新趋势，引进多台 Illumina新一代测序系统 Novaseq X Plus、华大测序平台 DNBSEQ-T7和 PacBio大型测序平台 Revio，全面覆盖最新的测序需求，并持续提升测序通量。同时，持续强化全球本地化交付战略，建立了完善的包括二代测序、三代测序、单细胞测序等前沿交付体系，为全球科研事业注入强劲动力，凭借通量大、产能高、可持续性等优势，为广大的终端客户提供更高效、更优质、更稳定的产品和服务体验。 在生物信息平台与团队建设方面，公司建立了高性能数据中心，总内存约 92TB，本地存储约 22.5PB，云存储可拓展至 100PB，计算峰值速度约 620T flops,能够有效支撑大数据分析和存储需求。同时，公司汇集生物学、医学、临床检验学、数学、物理、农学和计算机等专业领域的人才等一千余人，组建形成全球规模化的生物信息团队。 累计取得了生物信息的软件著作权 320项，自主开发的生物信息分析软件和流程为海量的组学数据解读提供支撑，为生命科学领域的科学家提供了标准化和高效化的生物信息分析流程方案。 在生产管理方面，持续推进精益管理理念，运用 VSM（价值流图）、SW（标准化作业）、5S、两箱系统、可视化管理、TPM（全面设备管理）及 TQM（全员质量管理）等工具，全员参与精益改善活动。全球实验室累计开展超 155 次精益改善活动，持续改善从样本收录、管理、提取、检测、建库、库检、到测序等各个环节，不断改善和提升各环节人效；在数字化管理方面，不断优化和改进交付等各环节的管理流程信息化水平，通过信息化系统的二次开发提高管理系统与生产环节的交互性，提升可追溯性，通过提升管理效率缩减成本、缩短交付周期、提升服务质量的稳定性。 （2）全力推动实验生产自动化体系 随着生命科学产业的蓬勃发展，以智能化+信息化解决传统模式的低效能、高成本问题成为必然趋势。公司是业内首次开展全流程生产自动化的企业，开创性地开发了全球领先的柔性智能交付系统，实现生产流程的自动化。2020年，公司推出高通量测序领域多产品并行的柔性智能交付平台 Falcon，实现了四大产品类型（WGS、WES、RNAseq 和建库测序产品）共线并行交付，极大的缩短了产品交付周期、提高了测序交付质量。2021 年，公司依托 Falcon的研发与运维经验，自主研发并推出小型柔性智能交付系统——Falcon II，其不仅具有“柔性智能”、“高效生产”、“稳定交付”的特点，还在 Falcon的设计基础上压缩了整体的占地面积，使之更加灵活便捷，为全球更多用户带来了优质服务体验。2024年，在 Falcon II的设计基础上，开发并落地了微生物扩增自动化产线，进一步提升微生物扩增子产品的生产交付能力。目前，公司已在英国、美国、天津、广州、上海等实验室部署了 Falcon II系统，实现了公司在全球主要实验室交付系统的智能化升级。 公司不断优化各操作环节的自动化水平，例如低温环境下的自动化样本收录技术、组织样本自动化分样技术、DNA核酸小体积自动测量技术、DNA核酸检测结果自动判定技术、DNA核酸高通量的自动打断技术、毛细管电泳检测自动上机技术、库检结果自动判定技术、包 Lane 测序自动化排机技术、生产工艺排程技术、生产工艺防错可视化技术及生信流程中断后自动续接技术等，通过提高自动化管理水平，减少人工误判，并降低成本、提高测序效率和测序稳定性。伴随这些技术的开发创新，也将进一步定义 NGS 测序行业标准，并为需求方提供更智能、更高效、更可靠的服务，满足科技服务领域的多样化需求。 （3）de novo测序技术（从头测序） 诺禾致源在 de novo测序技术和应用方面积累了明显的技术优势，累计已获得专利授权 19项，软件著作权 40余项，在国际期刊合作发表署名论文 145篇，累计影响因子超过 1,320，完成 1,000余个物种的基因组图谱构建，在全球范围内首次完成的藏猪、金丝猴、陆地棉、扇贝、天麻、黄河鲤、辣椒等物种的全基因组序列图谱，在行业内形成了显著的影响力。诺禾致源与国内多家科研院所开展了深度合作，助力基因组学文章发表于 Science、Nature Genetics、Science Advances、Nature Plants、Nature Communications、Genome Biology、Molecular Plant等多个国际权威期刊。在报告期内，公司在 de novo测序技术领域署名发表论文 17篇，累计影响因子 195。 （4）三代测序技术新应用 ① 在报告期内，PacBio Revio平台稳定运行，单 cell最高产出量（135.81GB）行业领先，并实现 7天极速稳定交付周期。当前已经完成了 300多个物种的基因组测序，包括哺乳动物、水产动物、软体动物、昆虫、作物、果蔬、林木、药用植物等。利用该技术，完成了首个辣椒的完美 T2T基因组序列图谱构建工作（截至发表最大的 T2T基因组），相关研究成果发表在《Nature communications》。 ② 成功推出了 Kinnex 全长转录组产品。此产品基于 Mas-seq 技术，该技术将cDNA分子连接成长片段后，应用 Pacbio Revio平台测序得到的高质量全长转录本序列。基于 Mas-seq技术获得的全长转录本 reads相比于传统的 Iso-Seq方法（基于 Sequel IIe平台）产生的单 cell全长转录本 reads数量提升了 14.8倍。 ③ 推出新产品 Pore-C 测序技术，将染色体构象捕获技术与 Nanopore 长读长测序技术结合。数据产出可达 40G/cell，达到市场领先水平，该技术突破了传统两两互作染色体片段解析的局限，可达到多向染色质交互信息的解析，同时还可解析基因组甲基化信息。 ④ 在人源标准样本测序方面，产出达标率超过 95%，并开发了基于 DNA低起始量（起始量低至 1ug）产品，该产品技术无需 PCR扩增，并不引入碱基偏好性，为人源类稀有样本（如临床穿刺活检样本）提供助力。 （5）分子育种技术 诺禾致源致力于以分子标记辅助表型选择为核心的育种策略开发，旨在加速新品种选育速度，推动分子育种产业化进程。在报告期内，诺禾致源基于多年的农业经济动植物组学经验，并基于开源的农业种质测序数据，推出了无需定制的高效检测商业化液相芯片产品 NGP（Novogene Germplasm resource screening panel），开发了用于羊草泛性状和柑橘遗传背景分子快速检测的 2款开创性育种芯片，还自主研发了 NGP-P-66K、NGP-C-5K、NGP-ZM40K等十余款常见农业种质的泛性状检测芯片，为育种家提供百元级、高效、便捷的芯片检测服务。诺禾致源还推出了全基因组低深度重测序育种方案，开发了大规模样本全基因组水平的高密度遗传标记的低深度基因型填充算法。以上两项技术的成功突破使诺禾致源在农业种质基因分型技术领域实现了高效低成本的技术创新，为分子育种领域的不断发展探索出新的可能性。 在报告期内，诺禾致源持续贯彻“育种一体化”理念，为分子育种的主要模块进行了持续升级，推出了揭示群体亲缘关系和群体遗传背景的种质资源筛选保护产品、开发了基于 GBLUP、BA、BB、BC、RRBLUP、SVR、DNNGP、BRR、BL等九种模型的育种值预测体系、建设了基于 KNN、随机森林、分类回归树、PLS、SVM、朴素贝叶斯等五种机器学习算法的精准品种鉴定架构。这些举措构建了坚实的技术框架，扩展了分子育种的发展空间。 在报告期内，诺禾致源还升级了种质资源数据库建设产品，为科学家提供种质多组学大数据的综合管理，涵盖水产、动物、作物、林木等多种物种。 报告期内，诺禾致源在分子育种领域获得了 5 项软著，并与合作伙伴在 Nature Genetics、Plant Physiology等权威期刊上累计发表论文 40余篇。 （6）转录组与表观组学测序技术 目前诺禾致源现已具备全转录组、翻译组、表观组、三维基因组的全面技术服务能力，可为多组学的转录调控研究提供整体性的解决方案。诺禾致源是转录组和调控组测序技术开发及应用的早期参与者之一，并对其持续投入技术创新开发，在转录组学测序和调控组学测序等复杂单项技术中形成了一系列的技术储备，以扩大新技术的应用场景，助力下游生命科学和生物医学研究的发展。截至 2024 年上半年，诺禾致源在转录组和表观组学测序领域已获得专利授权 5项、软件著作权 53项，并在国际期刊上发表了 15篇署名论文，包含《The Plant Cell》等顶级期刊，为科学研究继续提供最有力的支撑。 在报告期内，诺禾致源在转录组与表观组学实验技术和生物信息分析流程方面进行了创新改进，并推动了转录组和表观组学测序技术在肿瘤诊断、精准医学等领域的广泛应用。 在实验技术发展方面，持续不断优化技术细节，拓展产品应用边界。ATAC-seq已逐步攻克疑难样本出库难题，针对于家禽类、昆虫类、植物纤维类等疑难物种和组织部位进行专项优化，实现了包含棉花纤维/根茎、蜜蜂、鸡、鸭等疑难物种稳定出库；CUT&Tag转录因子数据质量稳步提升，通过调整前期处理环节实现 peak 1w+的突破，改善瞬时调控造成的数据质量差的现状；在 Hi-C 三维研究领域，打破业内固有送样量下线，成功搭建组织起始量 200mg，细胞起始量 5000个的微量单库生产体系，并进一步优化并提升了 Hi-C 建库测序数据有效率，达到先进水平。同时，在国自然热点技术翻译组学（Ribo-seq）上进一步加强产品核心竞争力，在建库起始量下降 5 倍的同时，进一步提升有效数据量和数据质量。自主研发的 Rloop CUT&Tag技术，用于探索基因组结构和不稳定性的现象，为肿瘤诊断和精准医学等领域的应用提供更多的技术储备与解决方案。 在生物信息分析流程方面，进一步优化软件算法，以达到提升数据利用率和结果准确性。在报告期内，诺禾致源实现了转录表观组学相关产品生物信息分析流程的完善与全新升级：搭建多套翻译组动力学生信分析流程，包密码子使用频率、翻译速率、起始密码子和终止密码子分析；开发 Rloop CUT&Tag全流程分析方案，搭建增强子/超级增强子高级分析流程，并且取得了累计 11 项软件著作授权。在多组学技术的融合方面，致力于开发转录组、翻译组、蛋白组多不同组学联合分析方案，为客户多层次、不同维度、全面地了解生物学系统的复杂性提供更多有效见解。在生物信息分析流程开发方面，聚焦于转录组及表观组相关产品分析流程的自动化改造，实现从建库测序到数据分析的自动化处理，进一步提升了我们的服务能力。 （7）宏基因组学测序技术 公司在宏基因组学领域取得了发明专利 4项，软件著作权 20余项，在国际期刊上发表署名论文 13篇。 在报告期内，诺禾致源持续深化宏基因组学产品在环境、医药和生命科学等研究领域的应用，全面升级了基于 Reads-mapping的浅宏基因组分析流程，实现了软件版本和分析点的同步升级。物种数量是老版本的的 2倍多，基因家族数量是老版本的 3倍多，对复杂样品（细菌、古菌、真核和病毒）可进行精确到种水平的物种注释，适用于高效、高性价比地分析大量的样本，助力大规模的宏基因组研究。 （8）单细胞测序技术 公司是国内最早开展单细胞测序技术应用的企业之一，早在 2012 年，公司即与北京大学联合在 Science 杂志上发表基于单细胞手段开展的人类单精子测序研究成果。 此后，公司持续深耕单细胞测序相关技术，目前已在单细胞方向已构建了包含组织样本单细胞解离，细胞流式分选，微流控液滴法单细胞捕获，微孔法单细胞捕获在内的一站化单细胞测序服务能力。此外，在空间组学上可开展空间转录组、空间蛋白组服务，并在报告期内建立了具备细胞级分辨率的空间原位测序技术，成为国内在单细胞测序方向上服务能力最为全面的企业之一。截至 2024年 6月 30日，公司已服务全球客户发表单细胞相关研究论文 250余篇。 近年来，细胞悬液的制备方法已成为单细胞测序技术应用拓展的难点之一。公司持续开展各类型组织样本的解离制备技术开发，目前已建立覆盖人、鼠、猪、牛、羊、水稻、玉米等 40 余个物种，上百种组织类型的悬液制备方法。此外，公司已建立成熟的单细胞单核测序技术，将各类冻存组织样本的处理成功率提升至 90%以上，突破了此前单细胞测序技术仅可应用于新鲜组织样本的局限性。公司通过整合流式细胞分选技术，进一步改善了心血管、骨、植物等杂质较多样本的制备质量，其中植物样本核悬液制备成功率已提升至 90%。通过持续开发上述各类组织处理技术，公司显著拓展了单细胞测序技术的应用范围，近 5年已成功完成上万例单细胞样本测序。 公司在空间组学样本处理技术上也开展了持续开发，除常规冻存样本外，公司建立了 FFPE样本处理技术，使得在医院病理科室中广泛保存的 FFPE样本能够较好的满足空间组学的需求。公司建立了 FFPE样本的单细胞解离技术，从而实现了病理样本的单细胞、空间多组学整合分析能力；公司还深入开发单细胞测序的应用方向，通过与三代测序技术结合，实现了单细胞水平的全长转录组分析能力，能够在细胞水平区分可变剪接体的表达，从而探索更精细的表达调控机制；通过与基因编辑技术结合，公司建立了单细胞水平上检测基因编辑效应的技术流程，能够在单细胞水平上开展基因的分子表型检测。 伴随单细胞测序需求的快速增长，相关数据的分析处理已逐步成为瓶颈之一。通过持续开展数据分析流程的自动化改造，目前公司已建立起一套覆盖从单细胞数据质控到多样本整合分析在内的自动化分析流程。公司开发了自动化细胞注释工具，结合公司建立的细胞标记基因数据库，摆脱了人工依赖，且准确性较高，显著改善了单细胞数据分析的效率。目前，公司单细胞测序整体交付周期在行业内具备较为显著的竞争优势。 （9）多组学数据联合分析技术 多组学技术在研究生物学、医学和生物工程等领域中广泛应用，并有助于发现新的疾病标志物、治疗靶点和药物设计。公司面向合作客户提供多种组学数据关联分析服务，为生命科学问题提供更加全面和系统的解决方案。生命系统是多组分互相联系的有机体，是高度复杂的庞大系统，单一组分、单一层次的研究无法满足复杂生物过程研究的需求，需要从多层次和多因素相互作用的全局性角度进行整合研究，才能完整地认识和揭示生命的复杂生理和病理活动。公司瞄准科研用户的最新需求，持续开发各类组学数据之间的整合分析解决方案，目前已具备基因组学、变异组学、转录组学、表观组学、代谢组学和微生物组学等多种组学技术联合分析方案，并以此开发了多组学数据库管理平台协助用户进行多组学海量数据的管理： ① 基于代谢组学的全基因组关联分析（Metabolite Genome-Wide Association Study, mGWAS） 代谢物是生物生长发育过程中重要的中间产物或终产物，是生命活动的最终体现。 代谢在基本细胞过程中的重要性以及用于代谢网络的大部分基因组解释了代谢改变在表型多样性中的突出地位。这些联系使得识别与表型变异相关的代谢特征很有吸引力。全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study，GWAS）是研究生物复杂性状的重要手段，可以有效的定位传统表型的关联候选基因。mGWAS是将代谢物测量指标作为衡量表型值，与种群基因型进行关联分析，用以鉴定与生物复杂性状相关的遗传标记或候选基因。该技术通过代谢助学和基因组变异组学层面共同揭示重要生物学农艺性状形成的分子机制。 mGWAS已广泛应用于农业科研领域，如动植物营养价值改良（果蔬；玉米、水稻大型农作物；猪牛等肉质、牛奶营养价值）、动植物风味改良（果蔬、玉米、水稻大型农作物）、药用植物活性成分鉴定及改良（板蓝根、紫苏等）、观赏植物改良（花色、香味等），以及医学科研领域，如糖尿病、血液病和代谢病等相关疾病病理解析和疾病相关生物学标记鉴定。 ② 图形泛基因组学技术 图形泛基因组学技术是一种用于研究多个相关生物体群体的基因组变异和多样性的方法，它整合了基因组学、变异组学与其他功能基因组学（如转录组学、表观组学等）的组学技术。图形泛基因组学技术通过对多个生物个体基因组组装，构建这些相关生物个体基因组的泛基因组序列集合，并表征它们的基因组结构变异图谱，包括大结构变异（SV）、序列拷贝数变异（CNV）、基因组易位变异（Translocation）、基因组序列倒位（Inversion）、序列插入与缺失变异（InDel）和单核苷酸多态性（SNP）。 诺禾致源持续推动和发展泛基因组关键核心技术，并推动该技术的广泛应用，2014年，诺禾致源与中国农业科学院作物科学研究所的野生大豆泛基因组研究因开启了植物泛基因组研究历程，并入选了 Nature发布的基因测序 20年里程碑事件，2017年，诺禾致源首次应用该技术于农业种质基因组研究，首次完成了农业动物——猪的泛基因组，该成果入选《中国农业科学重大进展》，推动了泛基因组学技术在农业基因组领域的应用；2021年，通过对 486个汉族人基因组的研究，提出了“泛基因组大小无上限”的数学模型，推动了泛基因组研究扩展到更大的群体规模； 2024年，诺禾致源引入了基于机器学习分类器策略的多物种基因同源预测工具 TOGA，扩展了图形泛基因组的技术边界。 ③ 基因组变异组学与微生物组学联合分析 在多细胞生物中，微生物对宿主的适应性有显著影响。基因组变异组学与微生物组学联合分析解决方案是通过测定宿主微生物的丰度，并与宿主基因组遗传变异进行关联分析，从而明确宿主遗传对宿主菌群的组成影响机制。诺禾致源自主开发了 16s的菌群分类单元丰度与宿主遗传变异的关联分析方法，宿主与微生物之间的水平基因转移分析方法，并已经成功应用于农业动物养殖和宿主与微生物群落协同进化等研究领域。 ④ 亚基因组等位基因表达偏好分析 随着测序技术的高速发展，测序成本的不断降低，二倍体（两套单倍型基因组）和多倍体物种参考基因组不断被公布。物种的各亚基因组之间常常存在一定的不平衡性，这种时空差异常由基因的表达调控机制引起，并对下游功能产生一定影响。公司开发了亚基因组等位基因表达偏好分析策略，用以探究物种亚基因组间的差异表达，有助于从宏观和层面理解多倍体基因组在物种发育过程中的复杂调控过程。 ⑤ 泛三维基因组分析 泛三维基因组是指 Hi-C 技术与泛基因组或重测序研究技术相结合，在考虑基因组序列、基因结构及其调控元件的同时，对基因组序列在细胞核内的三维空间结构与结构变异和基因家族功能研究相结合, 实现对物种基因组的遗传机制和生物功能的深入挖掘。 （10）基于基因测序核心技术开拓临床应用 公司基于 2018年 8月获批的“人 EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒（半导体测序法）”，进一步开拓入院业务，合作项目覆盖肿瘤、遗传、感染等临床检测方向，实现了临检业务协同增长。截止到 2024年 6月，诺禾致源累计在数十家医院完成试剂盒的入院。公司加强了基于 NGS 技术在遗传病临床上的转化应用。在罕见病领域，利用全外显子测序、全基因组测序、转录组测序等技术手段协助罕见病患者寻找致病原因，积极跟第三方医疗机构及三甲医院进行深入合作。在新生儿基因筛查、心血管系统、皮肤系统、眼科系统、血液系统等领域展开合作研究。同时探索长读长测序、甲基化测序等新技术的临床应用，助力出生缺陷三级预防体系。 公司继续增加研发投入，加大技术储备，积极布局感染病原体检测领域，其独立研发推出的病原宏基因组高通量检测产品（mNGS）PD-seq系列（呼吸系统感染检测、神经系统感染检测、血流系统感染检测、局灶感染检测）等 LDT 产品成功与多家三级甲等医院建立合作。与此同时，依托天津、广州、上海本地化医学检验所交付布局，通过不断优化迭代运营交付体系，开发自动化生信报告一体机及自动化建库系统，加快检测交付自动化、智能化，进一步缩短交付周期，提高交付质量，保障产品核心竞争力，实现样本量翻倍增长。 2023年 4月 10号，公司“自动化样本制备系统”（产品型号：NovoEMD LPS-32）正式获得天津市药品监督管理局的批准（注册证编号：津械注准 20232220075），实现 NGS 文库制备的自动化。涵盖肿瘤、遗传、感染的全自动化生信报告一体机也完成了硬件设计配置、分析流程和数据库的搭建，并且进行迭代开发。至此，公司实现了从核酸提取、文库构建、上机测序到数据分析的完整的自动化产品体系。 国家科学技术奖项获奖情况 □适用 √不适用 国家级专精特新“小巨人”企业、制造业“单项冠军”认定情况 √适用 □不适用
有关详情请参见公司 2023 年 7 月 21 日于上海证券交易所网站 （http://www.sse.com.cn）披露的《公司关于全资子公司入选国家级专精特新“小巨人”企业的自愿性披露公告》（公告编号：2023-027）。 2. 报告期内获得的研发成果 报告期内，公司研发投入 4,661.51 万元，占营业收入比例为 4.68%。截止报告期末，公司共获得专利授权 101项，其中发明专利 76项，获得软件著作权 425项。报告期内，新增发明专利授权 10项，软件著作权 69项。 报告期内获得的知识产权列表
3. 研发投入情况表 单位：元
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